Исследование процессов самоорганизации в бактериальных колониях, описываемых моделью Чави – Вадди – Колокольникова
https://doi.org/10.26583/vestnik.2025.4.4
EDN: MJQWIL
Аннотация
Исследована обобщенная модель Чави – Вадди – Колокольникова, применяемая для описания пространственно-временной динамики бактериальных колоний с учетом возможной «дисперсии» – механизма, отвечающего за миграцию и перераспределение популяции в окружающей среде. С биологической точки зрения благодаря рассматриваемой модели удается понять, как бактериальные клетки, способные к коллективному движению, формируют упорядоченные структуры (например, скопления или волны) даже при наличии внешних возмущений. Основной фокус работы направлен на исследование динамики системы бактериальных колоний, описываемых обобщенной моделью Чави – Вади – Колокольникова. Так, в работе разработан численный алгоритм для проведения математического моделирования данных процессов, проведена его верификация на базе точных решений рассматриваемой модели в виде уединенных волн. Исследовано влияние параметров задачи на поведение системы бактериальных колоний. Помимо этого, основное внимание в работе уделено изучению процессов самоорганизации бактерий, а также классификации динамики поведения системы для различных значений параметров рассматриваемой задачи.
Ключевые слова
Об авторах
А. Г. ГоловковРоссия
кафедра «Прикладная математика» (№31), инженер
П. Н. Рябов
Россия
к.ф.-м.н.
кафедра «Прикладная математика» (№31), доцент
Н. А. Кудряшов
Россия
доктор физико-математических наук, профессор
кафедра «Прикладная математика» (№31), главный научный сотрудник, заведующий кафедрой
Список литературы
1. Keller E.F, Segel Lee A. Traveling bands of chemotactic bacteria: a theoretical analysis // Journal of theoretical biology, 1971. V. 30(2). P. 235– 248.
2. Keller E.F, Segel Lee A. Initiation of slime mold aggregation viewed as an instability // Journal of theoretical biology, 1970. V.26(3). P. 399–415.
3. Keller E.F, Segel Lee A. Model for chemotaxis // Journal of theoretical biology, 1971. V. 30(2). Р. 225–234.
4. Horstmann D. From 1970 until present: the Keller-Segel model in chemotaxis and its consequences // Jahresbericht der Deutschen Mathematiker-Vereinigung ,2003. V.105(3). Р. 103-165.
5. Liu P. Shi J., Wang Z-A. Pattern formation of the attraction- repulsion Keller-Segel system // Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B ,2013. V.18. №10. P. 2597–2625.
6. Painter K. J., Hillen T. Volume-filling and quorum-sensing in models for chemosensitive movement // Canadian Applied Mathematics Quarterly journal, 2002. V.10. №4. Р. 501–543.
7. Chavanis P-H. A stochastic Keller–Segel model of chemotaxis // Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, 2010. V.15. №1. Р. 60–70.
8. Negreanu M., Tello J.I. Global existence and asymptotic behavior of solutions to a predator–prey chemotaxis system with two chemicals //Journal of Mathematical Analysis and Applications, 2019. V. 474. №.2. Р.1116–1131.
9. Xiang T. Sub-logistic source can prevent blow-up in the 2D minimal Keller-Segel chemotaxis system //Journal of Mathematical Physics, 2018. V.59. iss.8. doi: 10.1063/1.5018861
10. Mar´ee A.F. M., Panfilov A.V., Hogeweg P. Phototaxis during the slug stage of Dictyostelium discoideum: a model study // Proceedings of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences, 1999.V.266. iss.1426. P.1351–1360. doi: 10.1098/rspb.1999.0787
11. Giometto A., Altermatt F., Maritan A., Stocker R., Rinaldo A. Generalized receptor law governs phototaxis in the phytoplankton Euglena gracilis // Proceedings of the National Academy of Sciences, 2015. V.112. iss.22. P.7045–7050. doi: 10.1073/pnas.1422922112
12. Williams C.R., Bees M.A. Photo-gyrotactic bioconvection //Journal of fluid mechanics, 2011. V.678. P. 41–86. doi:10.1017/jfm.2011.100
13. Levy D., Requeijo T. Modeling group dynamics of phototaxis: From particle systems to PDEs // Discrete and Continuous Dynamical Systems Series B, 2008. V.9. iss.1. P.103-128. doi: 10.3934/dcdsb.2008.9.103
14. Galante A., Levy D. Modeling selective local interactions with memory // Physica D, 2013. V.260. P.176–190. doi: 10.1016/j.physd.2012.10.010.
15. Weinberg D., Levy D. Modeling selective local interactions with memory: Motion on a 2D lattice // Physica D, 2014. V.278-279. P.13–30. doi: 10.1016/j.physd.2014.04.001
16. Burriesci M., Bhaya D.. Tracking phototactic responses and modeling motility of Synecho-cystis sp. strain PCC6803 // Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, 2008. V. 91. iss.2-3. P.77–86. doi: 10.1016/j.jphotobiol.2008.01.012
17. Bhaya D. Light matters: phototaxis and signal transduction in unicellular cyanobacteria // Molecular mi-crobiology, 2004. V.53. iss.3. P. 745–754. DOI: 10.1111/j.1365-2958.2004.04160.x
18. Chavy-Waddy P.-Ch., Kolokolnikov Th. A local PDE model of aggregation formation in bacteri-al colonies // Nonlinearity, 2016. V.29. iss.10. P.3174. doi: 10.1088/0951-7715/29/10/3174
19. Kudryashov N.A., Kutukov A.A., Lavrova S.F. Properties of the generalized Chavy-Waddy–Kolokolnikov model for description of bacterial colonies // Communications in Nonlinear Science and Nu-merical Simulation, 2024. V.128. P.107645. doi:10.1016/j.cnsns.2023.107645
20. Kudryashov N.A., Ryabov P. N., Petrov B. A. Dissipative structures of the Kuramoto–Sivashinsky equation // Automatic Control and Computer Sciences, 2015. V.49. iss.7. P.508–513. doi: 10.3103/S0146411615070147
21. Kudryashov N.A., Lavrova S. F. Painlev´e Test, Phase Plane Analysis and Analytical Solutions of the Chavy–Waddy–Kolokolnikov Model for the Description of Bacterial Colonies // Mathematics, 2023. V.11(14). P.3203. doi: 10.3390/math11143203
22. Leo´n-Ram´ırez A., Gonza´lez-Gaxiola O., Chaco´n- Acosta G. Analytical solutions to the Chavy-Waddy–Kolokolnikov model of bacterial aggregates in phototaxis by three integration schemes // Mathematics, 2023. V.11. iss.10. P.2352. doi:10.3390/math11102352
23. Kudryashov N.A., Ryabov P. N., Fedyanin T.E., Kutukov A.A. Evolution of pattern formation under ion bombardment of substrate // Physics Letters A, 2013. V. 377. P.753–759. doi:10.1016/j.physleta.2013.01.007
Рецензия
Для цитирования:
Головков А.Г., Рябов П.Н., Кудряшов Н.А. Исследование процессов самоорганизации в бактериальных колониях, описываемых моделью Чави – Вадди – Колокольникова. Вестник НИЯУ МИФИ. 2025;14(4):318-331. https://doi.org/10.26583/vestnik.2025.4.4. EDN: MJQWIL
For citation:
Golovkov A.G., Ryabov P.N., Kudryashov N.A. Investigation of self-organization processes in bacterial colonies described by the Chavi-Waddy-Kolokolnikov model equation. Vestnik natsional'nogo issledovatel'skogo yadernogo universiteta "MIFI". 2025;14(4):318-331. (In Russ.) https://doi.org/10.26583/vestnik.2025.4.4. EDN: MJQWIL